A colaboração entre o Centro Nacional de Cultura e a UNESCO é cada vez mais intensa.
O CNC integra o Conselho Consultivo da Comissão Nacional da Unesco, sendo um dos três membros eleitos de entre representantes de instituições nacionais, fundações, associações ou academias de carácter educativo, cultural e científico que prosseguem atividades a nível nacional no âmbito das finalidades desta instituição.
É também uma das entidades fundadoras do Centro UNESCO para a Salvaguarda do Património Cultural Imaterial, criado em Beja a 6 de maio de 2016. Está a desenvolver uma parceria com a Cátedra Unesco “O Património Cultural dos Oceanos”, instalada na Universidade Nova de Lisboa, cuja atividade incide no património marítimo e subaquático.
